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血管生成實驗數據怎么分析,這些秘訣您都知道么?

date:2024-08-29 14:13:11

   管形成實驗是一種簡單但高效的的體外研究方法,用于篩選具有抗血管生成或促血管生成效果的物質。這些效果可以通過不同的參數來衡量,例如管的長度或凝膠表面上形成的環狀結構數量。

  

  要從管形成實驗中得出高效的分析結果,需要在實驗前、實驗中和實驗后考慮幾個方面,以確保結果的準確性和可重復性。

  

  本應用提供了在收集管形成實驗數據后進行分析的指南,并專注于分析和解釋這些數據。為優化您的實驗,請閱讀應用: Optimizing Tube Formation Assays優化管形成實驗。

  

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  ibidi為血管生成實驗提供多種解決方案:

 

  

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  1、管形成和血管生成分析的輸出參數

  “管”一詞描述的是在二維網狀中可見的細胞索,它 并不一定意味著這些細胞索有管腔。在管形成實驗中,可以從相位對比圖像中確定四個關鍵參數,如下圖所示:• 細胞覆蓋面積[%] (藍色區域)• 管長度[px] (紅色線條)• 分支點數 (白色點)• 環狀結構數量 (黃色數字)這些關鍵參數在實驗過程中彼此之間表現出一致的關系。因此,僅確定一個特征可能就足夠了:在本應用說明中,僅將管的長度作為管形成的代表性值。

  

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  相位圖像(A)和分析圖像(B)顯示了管形成分析的關鍵特征:細胞覆蓋面積(藍色)、管(紅色)、環路(黃色)和分支點(白色)。根據這些參數,可以計算出其它值,如平均管長、總管長和環的平均面積。

  

  從這些參數可以計算出更多的值,如平均管長、總管長度和環狀結構的平均面積。

  

  1.1、計算總管長度

  可以使用專用于管形成實驗分析的各種軟件進行圖像分析。

  

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  自動化管形成分析的示例輸出示例

  

  2、統計分析

  血管形成是一個涉及各種各樣的生化反應和信號通路復雜的過程。因此,建議每種處理條件至少使用三個生物學重復樣本進行統計分析,以獲得代表性值。

  

  為了進行可靠的分析并獲得平均值,我們推薦對每個條件進行多孔分析和復制。例如,每個被分析的孔都會得出一個管長值。這些值應該針對每個條件進行平均,并計算標準偏差。從同一載玻片上在相同條件下收集的數據點之間的標準偏差應小于10%。如果孔與孔之間的變化差異太大,則應參考以下應用指南來優化實驗條件:Optimizing  Tube  Formation Assays。

  

  以下圖表示例性地顯示了在兩種不同條件(Condition1與Condition2)下生長在 Matrigel®基質膠上的HUVEC細胞的總管長。使用搭載于相差顯微鏡上的ibidi Stage Top Incubator進行成像。對于每種條件,在四個不同的時間點(0h、4h、6h 及24h)分別對八個獨立的孔進行了成像。

  

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  對兩種生物條件下,四個不同時間點(0小時、4小時、6小時和24小時)的八個獨立孔的總管長度進行示例性數據分析。單個數據以點狀圖(左側)和箱線圖(右側)的形式顯示。

  

  這些單一數據點隨后被聚合并展示在一個箱線圖中。統計分析可以通過例如方差分析(ANOVA)或t檢驗(Student’s t-test)來進行,其中將不同條件的數據點相互測試。例如,t檢驗(Student’s t-test)提供了證據,表明兩個獨立的、具有t分布值的數據集之間是否存在統計學上的顯著差異。

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